Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdf15Q9Z0J7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf15Q9Z0J7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf15Q9Z0J7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf15Q9Z0J7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf15Q9Z0J7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdf15Q9Z0J7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms