Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrknQ9WVS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrknQ9WVS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrknQ9WVS6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrknQ9WVS6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrknQ9WVS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrknQ9WVS6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrknQ9WVS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrknQ9WVS6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PrknQ9WVS6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrknQ9WVS6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrknQ9WVS6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrknQ9WVS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrknQ9WVS6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms