Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Katna1Q9WV86 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katna1Q9WV86 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Katna1Q9WV86 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Katna1Q9WV86 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Katna1Q9WV86 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Katna1Q9WV86 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Katna1Q9WV86 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms