Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vax2Q9WTP9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vax2Q9WTP9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vax2Q9WTP9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vax2Q9WTP9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vax2Q9WTP9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax2Q9WTP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms