Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exo1Q9QZ11 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Exo1Q9QZ11 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exo1Q9QZ11 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Exo1Q9QZ11 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Exo1Q9QZ11 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exo1Q9QZ11 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exo1Q9QZ11 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms