Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcsk1nQ9QXV0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcsk1nQ9QXV0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcsk1nQ9QXV0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcsk1nQ9QXV0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcsk1nQ9QXV0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms