Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad18Q9QXK2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad18Q9QXK2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad18Q9QXK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad18Q9QXK2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad18Q9QXK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad18Q9QXK2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad18Q9QXK2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad18Q9QXK2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad18Q9QXK2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad18Q9QXK2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad18Q9QXK2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad18Q9QXK2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad18Q9QXK2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms