Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lsm4Q9QXA5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lsm4Q9QXA5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lsm4Q9QXA5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lsm4Q9QXA5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lsm4Q9QXA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm4Q9QXA5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms