Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PdcQ9QW08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PdcQ9QW08 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PdcQ9QW08 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PdcQ9QW08 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdcQ9QW08 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PdcQ9QW08 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PdcQ9QW08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms