Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc2lQ9JME7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc2lQ9JME7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc2lQ9JME7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc2lQ9JME7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc2lQ9JME7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms