Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnaja4Q9JMC3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaja4Q9JMC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnaja4Q9JMC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaja4Q9JMC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnaja4Q9JMC3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms