Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms