Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpf2Q9JJ80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpf2Q9JJ80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpf2Q9JJ80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpf2Q9JJ80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpf2Q9JJ80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpf2Q9JJ80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpf2Q9JJ80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpf2Q9JJ80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpf2Q9JJ80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpf2Q9JJ80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpf2Q9JJ80 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpf2Q9JJ80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpf2Q9JJ80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpf2Q9JJ80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpf2Q9JJ80 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms