Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrip2Q9JHR9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrip2Q9JHR9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrip2Q9JHR9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrip2Q9JHR9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrip2Q9JHR9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrip2Q9JHR9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms