Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ropn1lQ9EQ00 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ropn1lQ9EQ00 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ropn1lQ9EQ00 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms