Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r56Q9EPS9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r56Q9EPS9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r56Q9EPS9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r56Q9EPS9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r56Q9EPS9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r56Q9EPS9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r56Q9EPS9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r56Q9EPS9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r56Q9EPS9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r56Q9EPS9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r56Q9EPS9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r56Q9EPS9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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