Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmgn3Q9DCB1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgn3Q9DCB1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgn3Q9DCB1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgn3Q9DCB1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgn3Q9DCB1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn3Q9DCB1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn3Q9DCB1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms