Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem239Q9DA47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem239Q9DA47 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem239Q9DA47 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem239Q9DA47 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem239Q9DA47 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem239Q9DA47 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem239Q9DA47 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms