Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cib4Q9D9N5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cib4Q9D9N5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cib4Q9D9N5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cib4Q9D9N5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cib4Q9D9N5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cib4Q9D9N5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cib4Q9D9N5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cib4Q9D9N5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cib4Q9D9N5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cib4Q9D9N5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cib4Q9D9N5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cib4Q9D9N5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms