Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700109H08RikQ9D9C0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700109H08RikQ9D9C0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700109H08RikQ9D9C0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700109H08RikQ9D9C0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700109H08RikQ9D9C0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
1700109H08RikQ9D9C0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms