Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Erp27Q9D8U3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Erp27Q9D8U3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erp27Q9D8U3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erp27Q9D8U3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Erp27Q9D8U3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp27Q9D8U3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp27Q9D8U3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms