Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin37Q9D8N6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lin37Q9D8N6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lin37Q9D8N6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lin37Q9D8N6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lin37Q9D8N6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lin37Q9D8N6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lin37Q9D8N6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lin37Q9D8N6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lin37Q9D8N6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin37Q9D8N6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lin37Q9D8N6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms