Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rep15Q9D7T1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rep15Q9D7T1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rep15Q9D7T1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rep15Q9D7T1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rep15Q9D7T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rep15Q9D7T1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rep15Q9D7T1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rep15Q9D7T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rep15Q9D7T1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rep15Q9D7T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rep15Q9D7T1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rep15Q9D7T1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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