Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Klhl40Q9D783 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klhl40Q9D783 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Klhl40Q9D783 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klhl40Q9D783 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klhl40Q9D783 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klhl40Q9D783 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klhl40Q9D783 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl40Q9D783 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klhl40Q9D783 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Klhl40Q9D783 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klhl40Q9D783 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klhl40Q9D783 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klhl40Q9D783 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klhl40Q9D783 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Klhl40Q9D783 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klhl40Q9D783 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl40Q9D783 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Klhl40Q9D783 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Klhl40Q9D783 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Klhl40Q9D783 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Klhl40Q9D783 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms