Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TrirQ9D735 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrirQ9D735 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrirQ9D735 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrirQ9D735 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TrirQ9D735 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrirQ9D735 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.4 ms