Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nsmce1Q9D720 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nsmce1Q9D720 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nsmce1Q9D720 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nsmce1Q9D720 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsmce1Q9D720 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsmce1Q9D720 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nsmce1Q9D720 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms