Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3a3Q9D554 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3a3Q9D554 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3a3Q9D554 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3a3Q9D554 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3a3Q9D554 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3a3Q9D554 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3a3Q9D554 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms