Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tomm20lQ9D4V6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tomm20lQ9D4V6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tomm20lQ9D4V6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tomm20lQ9D4V6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tomm20lQ9D4V6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tomm20lQ9D4V6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tomm20lQ9D4V6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tomm20lQ9D4V6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tomm20lQ9D4V6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tomm20lQ9D4V6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tomm20lQ9D4V6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tomm20lQ9D4V6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms