Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam90a1bQ9D4F3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam90a1bQ9D4F3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam90a1bQ9D4F3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam90a1bQ9D4F3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam90a1bQ9D4F3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam90a1bQ9D4F3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam90a1bQ9D4F3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms