Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4933402E13RikQ9D4D2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
4933402E13RikQ9D4D2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
4933402E13RikQ9D4D2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4933402E13RikQ9D4D2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
4933402E13RikQ9D4D2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4933402E13RikQ9D4D2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
4933402E13RikQ9D4D2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
4933402E13RikQ9D4D2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4933402E13RikQ9D4D2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
4933402E13RikQ9D4D2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4933402E13RikQ9D4D2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4933402E13RikQ9D4D2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4933402E13RikQ9D4D2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4933402E13RikQ9D4D2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4933402E13RikQ9D4D2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4933402E13RikQ9D4D2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4933402E13RikQ9D4D2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4933402E13RikQ9D4D2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
4933402E13RikQ9D4D2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933402E13RikQ9D4D2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms