Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clvs1Q9D4C9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clvs1Q9D4C9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clvs1Q9D4C9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clvs1Q9D4C9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clvs1Q9D4C9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clvs1Q9D4C9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms