Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700034E13RikQ9D2T6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700034E13RikQ9D2T6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700034E13RikQ9D2T6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700034E13RikQ9D2T6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700034E13RikQ9D2T6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms