Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim42Q9D2H5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim42Q9D2H5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim42Q9D2H5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim42Q9D2H5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim42Q9D2H5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim42Q9D2H5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim42Q9D2H5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms