Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bcas2Q9D287 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcas2Q9D287 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Bcas2Q9D287 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bcas2Q9D287 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcas2Q9D287 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcas2Q9D287 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcas2Q9D287 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms