Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl53Q9D1H8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl53Q9D1H8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl53Q9D1H8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl53Q9D1H8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl53Q9D1H8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl53Q9D1H8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms