Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl28Q9D1B9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl28Q9D1B9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mrpl28Q9D1B9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mrpl28Q9D1B9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl28Q9D1B9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms