Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp1Q9CZP0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufsp1Q9CZP0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ufsp1Q9CZP0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ufsp1Q9CZP0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp1Q9CZP0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms