Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc77Q9CZH8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc77Q9CZH8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc77Q9CZH8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc77Q9CZH8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc77Q9CZH8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms