Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thumpd2Q9CZB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Thumpd2Q9CZB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Thumpd2Q9CZB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Thumpd2Q9CZB3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Thumpd2Q9CZB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Thumpd2Q9CZB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Thumpd2Q9CZB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Thumpd2Q9CZB3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Thumpd2Q9CZB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Thumpd2Q9CZB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Thumpd2Q9CZB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Thumpd2Q9CZB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Thumpd2Q9CZB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thumpd2Q9CZB3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thumpd2Q9CZB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Thumpd2Q9CZB3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms