Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snf8Q9CZ28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snf8Q9CZ28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snf8Q9CZ28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snf8Q9CZ28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snf8Q9CZ28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snf8Q9CZ28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snf8Q9CZ28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snf8Q9CZ28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snf8Q9CZ28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snf8Q9CZ28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snf8Q9CZ28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snf8Q9CZ28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snf8Q9CZ28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snf8Q9CZ28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snf8Q9CZ28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms