Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrtapQ9CYD3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrtapQ9CYD3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CrtapQ9CYD3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CrtapQ9CYD3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CrtapQ9CYD3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrtapQ9CYD3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms