Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mgme1Q9CXC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgme1Q9CXC3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mgme1Q9CXC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mgme1Q9CXC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mgme1Q9CXC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mgme1Q9CXC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mgme1Q9CXC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms