Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd8Q9CX56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd8Q9CX56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd8Q9CX56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd8Q9CX56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd8Q9CX56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd8Q9CX56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms