Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd4Q9CWX4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd4Q9CWX4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd4Q9CWX4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd4Q9CWX4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms