Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd12Q9CWU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd12Q9CWU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd12Q9CWU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd12Q9CWU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd12Q9CWU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd12Q9CWU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd12Q9CWU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd12Q9CWU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd12Q9CWU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms