Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Filip1Q9CS72 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Filip1Q9CS72 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Filip1Q9CS72 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Filip1Q9CS72 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Filip1Q9CS72 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Filip1Q9CS72 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Filip1Q9CS72 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Filip1Q9CS72 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Filip1Q9CS72 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Filip1Q9CS72 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Filip1Q9CS72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Filip1Q9CS72 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Filip1Q9CS72 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms