Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ1

Hsbp1, Heat shock factor-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsbp1Q9CQZ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hsbp1Q9CQZ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hsbp1Q9CQZ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hsbp1Q9CQZ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsbp1Q9CQZ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hsbp1Q9CQZ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hsbp1Q9CQZ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hsbp1Q9CQZ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hsbp1Q9CQZ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsbp1Q9CQZ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms