Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT9

Uncharacterized protein C20orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQT9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQT9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQT9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQT9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQT9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9CQT9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9CQT9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9CQT9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9CQT9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9CQT9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Q9CQT9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9CQT9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9CQT9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9CQT9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9CQT9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9CQT9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms