Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PsenenQ9CQR7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PsenenQ9CQR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PsenenQ9CQR7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PsenenQ9CQR7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PsenenQ9CQR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PsenenQ9CQR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PsenenQ9CQR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PsenenQ9CQR7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms