Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim8Q9CQQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim8Q9CQQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim8Q9CQQ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim8Q9CQQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim8Q9CQQ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim8Q9CQQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim8Q9CQQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim8Q9CQQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smim8Q9CQQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim8Q9CQQ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim8Q9CQQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms